百合原种有种左右，中国分布46种和18个变种，其中36种15个变种特有。

用于园艺育种和栽培的有40-50种，用于商品化生产的只有20种左右，主要包括麝香百合（Liliumlongiflorum），毛百合（L.dauricum），卷丹（L.lancifolium），山丹（L.concolor），天香百合（L.aurantum），药百合（L.speciosum），湖北百合（L.henyri），王百合（L.regale），白百合（L.brownii），川百合（L.davidii），青岛百合（L.tsingtauense），武岛百合（L.hansonii），日本百合（L.japonicum），玛多娜百合（L.candidum），马耳他恭百合（L.martagon）。以下就几个主要品种作描述。

卷丹百合（学名Liliumlancifolium）又名卷丹、天盖百合、倒垂莲、虎皮百合、珍珠花、*百合。

因花色橙红，花瓣反卷，故名“卷丹”，卷丹百合又因花瓣上有紫黑色斑纹，很像虎背之花纹，故有虎皮百合之雅称。原产中国、日本、朝鲜等地，现各地多有种植。株高70~厘米，间有高达1.5米的，可称百合之冠。球茎肥大，色白，可供食用和药用，稍带苦味。茎秆上着生黑紫色斑点，使株秆呈暗褐色。叶互生，狭披针形，无柄，密集于茎秆的中上部。叶腋间生有可繁植的珠芽。花夏季开放，数量较多，常3~10朵不等，花色橙红色或砖*色，花序总状，花瓣较长，约9~12厘米，向外翻卷，花瓣上有紫黑色斑点。花头下垂，雄蕊向四面张开，花药紫色。植株生长健壮，叶腋生珠芽，可以利用珠芽进行繁殖，三倍体卷丹用许多亚洲百合种授粉，都有种间亲和性，能得到种间杂种。

美丽百合（学名Liliumspeciosum）又名鹿子百合、艳红百合。

鹿子百合原产中国江西省、浙江省、台湾，及日本九州、四国西南滨海地区，株高60~厘米。叶对生，宽而疏，故名大叶百合。

茎上部开花数朵，花瓣向外反卷，雄蕊露出花瓣之外，花白色和淡红色，花瓣上布有玫瑰色花纹和斑点，状如鹿身上的斑纹，故有鹿子百合之美名。花色白者，称*子百合，花色红赤或紫者，叫赤鹿子百合。中国台湾的珍稀品种艳红鹿子百合（Lilium.speciousmThunb.var.gloriosoidesBaker.），被称为“东亚最美丽的百合花”。

山丹百合（学名Liliumpumilum）又名山丹花、山丹丹、珊瑚百合、线叶百合、细叶百合。因叶细而多，花冠似珊瑚得名。

株秆高30~40厘米，茎上生叶50~80厘米，细小纤弱，狭长如松叶。花春末夏初开放，花下垂，花瓣向外反卷，色鲜红，有光泽。鳞茎卵形或圆锥形，鳞片矩圆形或长卵形。地上茎高达60~80厘米；有小乳头状突起，有的带紫色条纹。叶散生，多数集中在茎的中部，条形，长可达10厘米，中脉下面突出，边缘有乳头状突起。花朵排列成总状花序，有香味；花被鲜红色，通常无斑点，强烈反卷；蜜腺两边有乳头状突起；花丝长约2.5厘米，红色；子房长约1厘米，花柱约长于子房1倍；柱头膨大，3裂。蒴果矩圆形。花期7~8月份，果熟期9~10月份。

麝香百合（学名L.longifforumThunb.），又名铁炮百合、复活节百合，是花卉百合的代表品种，花朵纯白，筒状，横向开放。原产我国台湾。